致许崇智电，请令本军先破沈逆，以防引北敌入粤。
亦是以“请令本军”之语气，直接提出作战主张，一改过去闪烁其辞的做法。
附蒋介石致许崇智电曰
三十电谅达。观察粤局，林部虽退寻邬，而潮惠洪杨终难就范，兄部在梅以势论，仍在其包围中也。如臧能于半月内出兵共定潮汕，固为上策，否则延宕日久，倘赣敌合林部进占北江，沈逆在省响应，惠杨阻我进路，潮洪捣我后方，似非必无之事。此时当注重省城根本，而潮汕次之。如臧不能以最速期内出兵，则本军当乘此林部退赣，敌线不能联络时机，从速通过梅属，直抵省城。或以一部集中北江，先平沈逆，巩固省城之根本，则潮惠各部不解自决，即用武力亦较易为功。总之本军一日不抵省城，则根本一日不安。以后粤局，潮惠之陈部为患尚小，而省中沈部通同北军实为腹心之患。北廷之所藉以乱粤者，亦重在沈部而不在陈部，沈部和平，则粤局自可奠定。以弟观察，臧部出兵恐不能如此之速，本军不如暂弃潮惠，以最速时期集中北江或省城为妥。一月内，如本军不能抵省平沈，则二月后赣敌攻粤，省城必危。若欲先平潮惠，最短时期亦须二月，窃恐潮惠水平之前，而沈逆引赣敌与林部攻粤，以时间而论粤患之缓急，则本军非先破沈不可。盖陈逆虽凶，至迎北军入粤则非其本愿，胡其为患较浅也。我军以主力分驻北江，或较全部集中省城为佳，以后平沈、平陈，皆赖本军自身，不能全恃客军，主客之嫌，尤宜豫〔预〕防以消内患。兄意如何。弟待奉复电后，当以个人名义赴粤一行。
附来电
介石兄鉴：介密。(一)兄目疾已愈否，甚念。(二)智于本日抵永定。(三)前方情报“梅属**约二十余营，已陆续退江西寻邬，会昌王献臣部亦有退瑞金之计。(四)我军令第八旅驻梅县，已饬相机进占兴宁；许、邱两部驻蕉岭，已饬进驻梅县；陆旅驻平远，五旅及十三旅驻大埔、三河。第三军全军二十集中平和，第二旅二十到龙岩，即向上杭挺进，沈永福部日内可到龙岩。”云。前奉总统电，智以为兄必已奉命赴粤，顷得总统支电，嘱“催兄赴粤”等语，兹悉兄尚在沪。总统左右现无军事人才，且粤未定，潮汕纠纷，一切处置关系甚大，请兄接电立即赴粤，并复。弟崇智手启。3月19日。
与杨庶堪书，主张廖长广东财厅，许军速回省。
蒋介石给大元帅府秘书处长杨庶堪写信，提出在他回广州之前，需发表任命廖仲恺主管财政、许崇智部调回省城两道命令，否则他回广州后无法开展工作。蒋介石直接并狂妄地向孙中山提主张、讲条件，并干预人事安排，自认为自己在孙中山的心目中，地位提高了。
附蒋介石致杨庶堪书
弟定元日起程，敬将以后进行意见略述之。军事当促许军克期抵省，会合在省各友军先谋集中，然后再定一共同作战方案，以为攻守剿抚进行之程序，使其任务分明，精神团结，不致有参差不一、主客异形之嫌。政治当以整理财政为先，厅长不速易人，延误大局必非浅鲜。弟对此点自信见解或较在粤诸公正确，故欲行之前，不得不将此等成败关键竭忠尽言，决非有何作用参于其间也。财政如无把握，军事难定计划，廖任厅长，许速回省，二令可否在弟起程前发表，俾弟到省后即可着手进行，而鼓来者之气也。彷徨日夕，伫盼复言。
随大元帅劳军江村，自办公大本营后，陈猷决策，草檄批牍，筹战守，馈饷糈，出随车驾，入掌枢机，日不暇给，责任丛集于一身矣。
4月20日蒋介石到达广州，以大元帅参谋长的名义入大帅府办公。刚刚五六天，便把他忙得焦头烂额，报起辛苦来了。岂不知由于他蒋介石迟迟不来广州，致使4月16日沈鸿英部在广州叛变，孙中山身边既无嫡系部队，又无蒋介石的参谋，只好亲自出马督战，率领杨希闵的滇军和刘震寰的桂军，于4月19日将沈鸿英部赶出广州。那时节，孙中山是何等的辛苦?!蒋实在应扪心自问自己所为是否有愧?
上午随大元帅巡视至连江口，深夜假寐车中，至翌晨，始回抵大本营。
自闻陈逆乘机蠢动，即拟定东江作战计划。
此时，蒋介石以大元帅参谋长的名义，经常陪同孙中山视察、制定军事计划、慰劳各部队，着实尽职尽责。
侦知逆属陈修爵率部进占龙门，图袭增城，杨坤如又叛攻石龙，彻夜苦筹抵御之策。
5月9日，陈炯明从东江再次叛乱，大规模向广州反扑。被赶出广州的沈鸿英部，又勾结北洋军阀吴佩孚，从广州北部猖狂反攻，孙中山两面受敌，处境十分险恶。蒋介石身为孙中山的参谋长理应责无旁贷，积极筹划御敌之策。
抵博罗城，会刘震寰总司令等，议决作战计划。晚后，往平湖，与范石生师长长谈竟夕，昧爽回石龙。
总理令许崇智固守潮汕。
5月20日，讨贼军对陈炯明的根据地惠州发动总攻击，但陈部叛军出奇迂回作战，攻陷讨贼军背后之博罗，讨贼军形势为之不稳。
蒋介石乃请孙中山亲赴前线督战，并随同出发。在即将到达石龙时，碰到一群溃兵张惶失措地谣传石龙已经失陷，可是，蒋介石则判断情况不至于坏到如此程度，一定是军心浮动，散播着以讹传讹的谣言。
为此，蒋介石想出了一个计策：亲自率领卫队200人扬言叛军业已溃退，孙中山也率先领导前进，因之立见功效，士兵们气势大增，转退为进。
经过两昼夜激战，收复博罗城，距博罗50公里的石龙江明并未被敌攻陷，蒋介石的奇计得到孙中山的赞赏。随即，孙中山与蒋介石议决作战计划，令许崇智固守潮汕，以扩大战果。
闻潮汕失守，顿足叹回：“汝为(许崇智)不听吾言，致有此败，可痛可恨。”
蒋介石此刻虽然名义上是大元帅的参谋长，但手中仍然没有一兵一卒。要贯彻他制定的军事计划，都要就商于各军的司令部，仰人鼻息，困难重重。不但滇桂这些客军不听从指挥，就连许崇智也不接受他的作战计划，以致潮汕失守。
晨，陟葫芦山，了览博罗形胜，谓一天然防地。午正，随大元帅赴惠州，至白沙对岸，舍船步行。道红泥坑，视察北门阵地，至深坑附近，始易舆。次花围水(在飞鹅岭下)慰问刘总司令创痍，即登虎头岭，俯瞩惠城形势。回至白沙已深宵二时矣。
经过近一个月的作战，敌我双方各有胜负，形成拉锯战。孙中山所依靠的滇桂联军也都是些打着革命旗帜，为自己争权夺利的野心军阀，根本不热心为孙中山的广东革命政权作战。广州政府仍处在四面受敌的危险之中。蒋介石这时期一直跟随孙中山亲赴前线督师，为捍卫广州革命政府竭尽全力。
扈驾巡视北江战线，至英德之巫村，杨总司令等皆来谒见，即与商议战事。夜半，回至省垣。谓：“自?江至英继，岭?径窄，地形便于防守，乃知敌军之不易越进，盖亦有故也。”
这一天，孙中山重新任命蒋介石为大元帅行营参谋长，故而蒋为之一振，巡视战线、商议战事颇为经心。
侍从帅驾往博罗，为调滇军增援北江，恐东江军心动摇，且阻许崇智假回省城也。
蒋介石跟随孙中山督师调兵、视察谋划。同时以大本营的名义命令许崇智率军反攻，收复失地，劝阻其勿要返回省城。
随往白沙堆，与刘震寰及东江各将领议决以许部三旅专任攻御惠州，悉调滇军赴援北江。
是日，许崇智以潮汕之败迁怒于我，答云：“可仍回总部赞助。”许始释然。
许崇智一直反对蒋介石的攻打陈炯明老巢惠州的计划，他在潮汕打了败仗，也迁怒蒋介石。
晨，早醒，默念苦持军事，怨忌交集，引退为安。然以总理知遇之深，则又不忍遽去，心殊怆恍。上午，扈驾至韶关，自英德以上，山形地势仿佛桂林，英石煤矿所在皆是。以第一次至此，顾而乐之。晚，与滇军各将领会议进击南雄之敌，及统一财政办法。夜十二时回。
此刻，蒋介石脑中又酿出“引退为安”的想头。
在攻克惠州之前的6月16日，孙中山重新任命蒋介石为大元帅行营参谋长。但在参佐军务方面却又受到一些人的忌刻。于是蒋介石就想：如果不是同一地区出身，没有掌握可以自成派系的私兵，就算是跻身于业已阵容一新的讨贼军中，也是属于劣势。面对现实，为期军中人事关系圆融，实以个人引退为宜，但为了要报答孙中山的知遇，却又不忍离去，颇为苦恼。
为许崇智所?，愤而辞职，避驻香港。
滇桂客军将领不听指挥也罢，就连一向友好的许崇智亦不容，因此，使蒋介石感到“参佐军务，不为人谅，反遭啮?”。结果，蒋介石到任还不到三个月，便“愤然辞职”，离开苦战中的孙中山，回避到香港。
后来，在复上孙中山的函呈中，向孙中山说明理由为：“……倾轧之祸，甚于壅蔽，娼嫉之患，烈于党争，此岂愚如中正者所能忍受哉……”
禀承总理意旨，约会苏俄代表马林及张继、汪兆铭、林业明等，筹组孙逸仙博士代表团，赴俄报聘，并考察政治及党务。
蒋介石在7月12日离开广州避往香港时，就已经知道孙中山接受了苏联的邀请，决定派出代表团到苏联考察，他便在7月13日从香港写信给大元帅府秘书长杨庶堪，表达他对孙中山的要求：“为今之计，舍允我赴欧外，则弟以为无一事是我中正所能办者”，“如不允我赴俄，则弟只有消极独善，以求自全。”
8月5日孙中山写信叫蒋介石到上海，与共产国际的代表马林商谈赴俄考察事宜。在上海与马林商谈的除蒋介石外，还有汪精卫、张继、林业明等人，最后决定由国民党人蒋介石、王登云、沈定一(后参加中国**)和**人张太雷组成“孙逸仙博士代表团”。
由蒋介石担任相当于团长职务而组成的“孙逸仙博士代表团”，代替孙中山前往苏联，目的是考察其政治、军事和党务，而特别关心的是苏联红军的长处与短处。
孙中山在广州虽然位居大元帅之尊，但是苦于陈炯明以及各军阀叛乱的困扰，深深地感到要想达成革命目的，则军阀拥兵不仅不能为助，反而是一种障碍，因此有必要编练一支在革命精神统率之下的强劲直辖部队――党军。
为培育这样的军队，孙中山便考虑到设立军事学校。认为苏联的军事制度不无可供参考之处。蒋介石以前学过一点俄文，加上计划在将来设立的军事学校预备由他来负责，故而被选中担任这个考察任务。当然，也是以此对闹个人情绪的蒋介石的一种安抚。
率沈定一、张太雷、王登云等，由上海趁神(?)丸启程赴俄。
8月16日，由蒋介石率领沈定一、王登云、张太雷等，乘“神田丸”轮船，由上海启程。